吐鲁番市距乌鲁木齐187公里,有火车和汽车可通。吐鲁番火车站设在大河沿镇,距吐鲁番市区约40公里,有公交车穿梭往返。兰新线、南疆线各次列车均在吐鲁番站停靠,乘火车从吐鲁番到乌鲁木齐大约需要2个半小时。
吐鲁番长途车站有开往全疆各地的长途巴士。